El Filibusterismo es una novela de medios y de fines que trata de dar forma al objeto (la nacionalidad filipina como garante de una nación, si no en forma de Estado, sí de justicia social), y los medios para alcanzarlo (reforma o revolución). Consecuentemente, la obra presenta dos grandes cuestiones: la que afecta a la cultura y a la construcción del concepto de filipino, y la que afecta a la política y la construcción del concepto de Filipinas.